虾类代谢:乳酸脱氢酶(c31)、糖原磷酸化酶(c34)和蛋白激酶(PK)在RNA干扰中的作用
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抽象的
能量新陈代谢在脊椎动物系统中得到良好研究,为生物生存所需的不同途径的基因和机制提供了洞察力。然而,这种研究仍然缺乏虾类中的无脊椎动物系统。早期的研究表明,来自黑虎虾的几个葡萄蝇与白斑综合征病毒(WSSV),虾中的毁灭性病原体,包括Contig 31-WSSVORF82(C31)和CONTIG 34-WSSVORF21(C34)。本研究旨在揭示三种基因:C31,C34和蛋白激酶(PK)在虾系统中的作用及其在WSSV感染中的可能作用。CDNA末端聚合酶链反应或RACE-PCR的快速扩增用于获得C31和C34的全长序列,然后使用RNAI技术进行体内基因沉默,并肌内注射DSRNA至WSSVALLENGED Macrobrachium Rosenbergii和Penaeus(Marsupenaeus)japonicus。基因表达遵循健康的虾和DsRNA处理的虾。
MRC31被揭示为酶乳糖酶脱氢酶(LDH),通常在组织损伤期间释放,是疾病的标志物。最具宽松的树描绘了MRC31,将MRC31成为其他虾类的LDH,Penaeus Monodon和P.Vannamei的LDH,分别支持100%和72%的Bootstrap值。MRC34对其他生物的糖原磷酸化酶(GP)酶高度同源,包括另一种虾,粳稻,患有99%的举射值。对于PK,系统发育分析表明,来自P.Monodon,M.Rosenbergii和P.Paponicus的三个开放阅读框(ORF)对WSSV-PK的同源性为98%的引导值。来自DSRNA治疗和WSSV感染的虾的死亡数据显示,与对照,磷酸盐缓冲盐水(PBS)和绿色荧光蛋白(GFP)相比,用DSRNA-LDH,GP和PK处理具有显着较高的存活率。沉默虾中的三种基因对病毒具有一些保护作用。基因表达表明,所有三种基因都存在于免疫相关器官中,例如鳃,肝病和血细胞。本研究是第一个报告Contigs 31,34和PK的可能身份和功能,为虾的基因组提供有价值的数据。
描述
摘要。
建议引用
Tare,M. V. R.,Kondo,H.,Hirono,I.,Maningas,M. B. B.(2015)。虾代谢:乳酸脱氢酶(C31),糖原磷酸化酶(C34)和蛋白激酶(PK)的作用,如RNA干扰所显示的。In M. R. R. Romana-Eguia, F. D. Parado-Estepa, N. D. Salayo, & M. J. H. Lebata-Ramos (Eds.), Resource Enhancement and Sustainable Aquaculture Practices in Southeast Asia: Challenges in Responsible Production of Aquatic Species: Proceedings of the International Workshop on Resource Enhancement and Sustainable Aquaculture Practices in Southeast Asia 2014 (RESA) (p. 355). Tigbauan, Iloilo, Philippines: Aquaculture Department, Southeast Asian Fisheries Development Center.